Baker团队用全原子扩散模型RFD3设计出人工酶

David Baker团队在Science发表基于全原子生成模型RFdiffusion3（RFD3）的蛋白质设计研究，实验获得两类人工酶：可水解有机磷化合物的磷酸三酯酶，以及可选择性切割TTR衍生肽段的人工蛋白酶。 其中蛋白酶的首批96个候选设计中有4个显示催化活性，kcat为0.015 ± 0.003 s⁻¹，催化效率kcat/KM为1100 ± 300 M⁻¹ s⁻¹，处于某些天然蛋白酶催化效率范围的下端。这一结果展示了按指定底物设计人工蛋白酶的潜力，但尚未证明能清除人体内的TTR淀粉样沉积，更不意味着已获得治疗药物。

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