PIDiff:序列与SE(3)结构联合扩散的蛋白质界面设计框架
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PIDiff:序列与SE(3)结构联合扩散的蛋白质界面设计框架
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AI 综述
Zhenqiao Song、Jianwen Xie、Lei Li 等发布论文,提出面向蛋白质—蛋白质复合物设计的多模态扩散框架 PIDiff,在离散序列空间与连续 SE(3) 结构流形上联合生成目标条件下的序列与结构,并由 PIFomer 交替融合几何感知注意力与全局序列注意力。团队还构建了来自 PDB、含多样目标支架的蛋白质复合物数据集 PIBench,先在 PIBench 上预训练,再微调用于迷你结合蛋白设计和抗体设计两个治疗相关任务。 基于论文摘要,作者称该方法在迷你结合蛋白和抗体设计任务中优于基线;摘要末句将方法称作 PPFrame,与正文命名 PIDiff 不一致,具体命名与实验细节需核对全文。
AI 根据报道生成 · 3 小时前更新
最新进展10月14日 12:00
PIDiff:联合离散序列与SE(3)扩散进行蛋白质界面设计报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月14日
- arXiv · cs.AIPIDiff:联合离散序列与SE(3)扩散进行蛋白质界面设计
PIDiff是一种面向蛋白质—蛋白质复合物设计的理化性质增强多模态扩散框架,联合生成目标条件下的蛋白质序列与结构。方法在离散序列空间和连续SE(3)结构流形上进行扩散,并由PIFormer交替融合几何感知注意力与全局序列注意力;摘要称其在迷你结合蛋白和抗体设计任务中优于基线,但末句将方法称为PPFrame,具体命名与实验细节需核对全文。
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