SGES以适应度子空间提升定向进化
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SGES以适应度子空间提升定向进化
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AI 综述
SiYuan Ma等在arXiv预印本中提出线性适应度子空间(LFS)假设与子空间引导进化搜索方法SGES;基于少量初始样本估计LFS,并在该子空间内完成代理建模、不确定性估计和候选获取,在限定测试中提升了蛋白质适应度预测与搜索效率。 结果覆盖ProteinGym的10个核心测试、87个扩展静态验证测试及18个预算受限的定向进化测试,比较对象包括零样本蛋白质语言模型和近期机器学习引导优化基线。作者称,LFS是局部、可由监督信号恢复的陈述,不意味着蛋白质适应度景观或蛋白质语言模型的全局几何普遍线性;材料未提供实验湿验证或独立复现。
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最新进展10月7日 12:00
蛋白质语言模型中的线性适应度子空间支持样本高效定向进化报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月7日
- arXiv · cs.AI蛋白质语言模型中的线性适应度子空间支持样本高效定向进化
作者提出线性适应度子空间(LFS)假设,认为蛋白质突变引起的残基级表示变化中,少数与特定实验测定相关的方向即可线性解释适应度变化,并据此提出Subspace-Guided Evolutionary Search(SGES)。
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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。